המכון למחקרי ביטחון לאומי הגיש לנשיא הרצוג מסמך הסוקר את האתגרים העיקריים של ישראל והעריך שאיראן בטווח של חודשים מפריצה לפצצת גרעין. "יש להיערך לתרחיש של אי-השגת הסכם, שבו איראן היא מדינה 'סף גרעינית'"
שר הביטחון טען כי, "אם נדחה או נקטין את החלת הריבונות, הזדמנות המאה תהפוך לפספוס המאה". לדבריו, "שרי ממשלה מסבירים לנו שיש עבודת מטה, שצריך תהליך מול היועמ"ש. מה שיידחה לאחר הבחירות, לעולם לא יקרה. כולנו מבינים את זה"
בהערכה האסטרטגית של המכון צוין כי קיימת סכנה לעימות רחב היקף לנוכח הנחישות האיראנית ומאמצי חיזבאללה להשיג יכולת תקיפה מדויקת. "מלחמה כוללת בצפון היא האיום החמור ביותר, גובר הסיכוי להסלמה בעזה ובגדה, ומול איראן צריך תיאום עם ארה"ב"