מחקירה של חוקרי כבאות והצלה תחנה אזורית ירושלים עולה, כי השריפה בישיבת פורת החלה בעקבות עבודות ריתוך וחיתוך ברזל.
כתוצאה מעבודות אלו, נוצרו גיצים אשר נפלו מהקומה העליונה במבנה אל אולם בית המדרש בישיבה, הציתו וילונות ומשם האש התפשטה במהירות לספריית ספרי הלימוד של הישיבה ובתוך זמן קצר יצאה האש משליטה.
כתוצאה מהתפתחות השריפה במבנה, נלכדו חלק מהתלמידים בישיבה בעשן הכבד שנפלט מהשריפה.
לוחמי האש שהגיעו למקום, חילצו ופינו את הלכודים, ביצעו כיבוי של הלהבות שאיימו לכלות את הבניין, ובכך מנעו פגיעה בנפש ונזק אדיר למבנה ההיסטורי.
לא ייאמן פשוט חוסר אחריות נדירה
נתנאל היקר.
אין חוסר אחריות, יש גזירת ה'.
הכל בידי שמים חוץ מיראת שמים וכו'.
לכן לא היה ניתן למנוע מקרה זה ע"י יתר אחריות.