החלטתו השערורייתית של בג"ץ לאסור על המדינה לתקצב את בני הישבות שגיוסם נדחה על ידי שר הביטחון, עוררה תגובות נזעמות בקרב הנציגים החרדיים בכנסת, שלא חסכו את שבט לשונם משופטי הבג"ץ ותקפו אותם במילים חריפות במיוחד.
חבר הכנסת הרב יעקב ליצמן האשים הערב כי שופטי בג"ץ "מבצעים 'כביש עוקף מחוקק' וכופים בפסיקתם החלטה המבטאת דעתם האישית, בנושא שנמצא בדיון בוועדת שקד. חמור מאוד שבג"ץ רואה עצמו מעל החוק וחורץ דינם של בני הישיבות, שדחיית גיוסם נעשתה כחוק בידי שר הבטחון, וכעת נהפכו כבני ערובה, בניסיון להפעיל לחצים על הדיונים שמתקיימים בכנסת. בני הישיבות שתורתם אומנתם ימשיכו בתלמודם ושום כוח, כלכלי או פלילי, לא ימנע זאת מהם, לא כעת וגם לא בהמשך".
חבר הכנסת הרב משה גפני אמר בתגובה להחלטה: "לא הייתה פעם אחת שבית המשפט סייע לציבור החרדי, אלא להיפך – פגע במשפחותיו, ילדיו ודרך חייו בכל פעם מחדש. הפסקת תקצוב הישיבות היא עליית מדרגה חמורה והכרזת מלחמה נגד הציבור החרדי בארץ ובעולם, ובעזרת השם אנו נשיב מלחמה. בית המשפט היום נהג בבריונות. תקציב הישיבות ניתן בזכות ולא בחסד, ואיננו מותנה בגיוס ובכל תנאי אחר. ככל אזרחי ישראל אנו זכאים לתקציבים, וכפי שמכספי המיסים והסיוע האמריקני מופנה מיליארדים לתרבות אמנות, ספורט ופעילות שפעמים רבות היא נגד המדינה – אף תקציב הישיבות ניתן למוסדות אשר מאות אלפי אזרחים בישראל רואים בהם את הערך העליון של העם היהודי, לימוד התורה".
ח"כ הרב מאיר פרוש הגיב לפסיקת בג"ץ ואמר כי "החלטת בג"ץ מעלה גיחוך, שהרי הוא הגוף האחרון שיכול להטיף על סחבת בדיונים, ועל איחור במתן פסקי דין. בג"ץ כבר לא מהיום מוכר כאויב כלפי הציבור החרדי, בפסיקותיו המפלות".
הרב פרוש הוסיף עוד: "זו החלטה פוגענית ומיותרת, התורמת להעמקת השסע והקרע בחברה הישראלית, ולהרגשה של הציבור החרדי שהוא נמצא במתקפה תקשורתית, חקיקתית ושיפוטית. זאת עוד החלטה היוצאת לצערנו מבית המשפט ברוח התקופה של הדה-לגיטימציה הנעשית לציבור החרדי, בכנסת ובתקשורת".
חבר הכנסת הרב אורי מקלב אמר הערב למהדורה המרכזית של “קול חי”, כי בעבר ניתן היה להתמודד עם החלטות בג”צ באמצעות חקיקה, אך הממשלה הנוכחית מסייעת לבית המשפט העליון, לפגוע בעולם התורה. הרב מקלב הצהיר כי עולם התורה ימשיך להתקיים חרף הגזירות.
מתנועת ש"ס נמסר: "צר לנו ששופטי בג״ץ הצטרפו הערב לרדיפת עולם התורה תוך התערבות ברגל גסה בהליך חקיקה רגיש שבימים אלו נדון בבית המחוקקים.
"שר הביטחון פועל בשיקול דעת ועל פי סמכותו החוקית" נאמר בתגובתה של סיעת ש"ס, "ומשכך אין קשר בין דחית הגיוס לתקציב הישיבות, ההחלטה לפעול דווקא בסנקציות כלכליות נועדה אך ורק ע״מ להצטרף לעליהום וההסתה נגד לומדי התורה בארץ ישראל".
תגובה מעניינת התקבלה מלשכתו של שר הבינוי והשיכון אורי אריאל:" החלטת בג"ץ אינה ראויה" נאמר בהודעה שפרסם השר, "היא פוגעת באוכלוסיה שלמה, ובמרקם העדין בין הציבורים השונים במדינת ישראל. היה ראוי כי בג"ץ ימתין לסיום כל הליכי החקיקה בוועדת שקד, שיסדיר את כל הנושאים כולל תקצוב הישיבות ולא יקבל החלטות הגורמות לקרע נוסף בעם."
אני בכלל חרדי יורד לחו״ל ונהנה מהחיים ומשלים עם זה שמדינת ישראל לא יתקיים להרבה זמן אבל לאחי ומשפחתי בארץ אני אומר להם אנחנו החרדים האשכנזים יהדות התורה לא לאומנים ולא שלומ׳נים לא נלך לצבא. שאתם תיהרגו , מה אתם מאיימים שלא יהיה כסף ותקציבים ? אז שלא יהיה כסף שלא יהיה תקציבים . איך אמר ״האח״ עוד לא נברא העם שיוותר על עקרונות שלו בשביל כסף , גם ככה אנחנו העיקרון שלנו לא ליהרג.