מקורב לראש הממשלה בנימין נתניהו עוכב לחקירה הבוקר (שני) בחשד למעורבות בפרשת הצוללות, יחד עם חמישה בני אדם נוספים. בשלב זה טרם הותרו לפרסום שמות החשודים, אך ניתן לומר כי שלושה מהם החזיקו בתפקידים בכירים בעת החשד לביצוע העבירות.
מהמשטרה נמסר כי במסגרת חקירה משותפת של משטרת ישראל, רשות המסים, הרשות לאיסור הלבנת הון ומימון טרור, ובליווי פרקליטות מיסוי וכלכלה, עוכבו החשודים לחקירה באזהרה בחשד לביצוע עבירות שוחד וקבלת דבר במרמה, עבירות מס על פי פקודת מס הכנסה וחוק מע"מ, וכן הלבנת הון, במסגרת פרשת הצוללות.
המשטרה עדכנה כי בזמן התרחשות האירועים, היו חלק מהחשודים המעורבים עובדי ציבור, ואילו אחרים פעלו במגזר הפרטי. החקירה מתנהלת בלהב 433 ביחידה הארצית למאבק בפשיעה כלכלית, ומתבצעת "בשיתוף פעולה מלא עם פקיד שומה חקירות תל אביב ברשות המסים, הרשות לאיסור הלבנת הון ומימון טרור, וכן בליווי ופיקוח של פרקליט המדינה", נמסר מהמשטרה.
המשטרה תבקש להאריך את מעצרם של חלק מהחשודים בבית המשפט בראשון לציון בצהריים, כשבין החשודים אחד מיועציו הקרובים של נתניהו, ומקורב נוסף, שהתמודד בעבר לתפקיד ביטחוני רגיש, אולם מינויו סוכל. חשוד נוסף שעוכב מקושר לחברה הגרמנית שבונה את הספינות, ונחשב לדמות מרכזית בפרשה. במשטרה אמרו כי גל המעצרים והעיכובים בוצע לפנות בוקר כדי למנוע שיבוש חקירה ותיאום גרסאות בין המעורבים.
לאחר שהשישה עוכבו לחקירה, הדגיש בשנית היועץ המשפטי לממשלה אביחי מנדלבליט כי נתניהו אינו חשוד בפרשה. עם זאת, הדברים מגיעים בניגוד להצהרותיהם של שר הביטחון לשעבר משה (בוגי) יעלון וח"כ אראל מרגלית לפיהם ראש הממשלה אכן היה מעורב בפעילות פלילית.
לפני חמישה חודשים הפכה הבדיקה בעניין רכש כלי השיט מגרמניה, המכונה "פרשה 3000", לחקירה פלילית. במסגרת החקירה נבדקים ההליכים לרכישת שלוש צוללות וארבע ספינות מהתאגיד הגרמני "טיסנקרופ" שנציגו בישראל, מיקי גנור, יוצג על ידי עו"ד דוד שמרון, עורך דינו ובן דודו של ראש הממשלה בנימין נתניהו. עם זאת, נתניהו אינו בין החשודים בפרשה.